由南京農業(yè)大學(xué)作物遺傳與種質(zhì)創(chuàng )新國家重點(diǎn)實(shí)驗室張天真教授和陳增建教授牽頭的一個(gè)國際合作團隊共同近日完成了陸地棉基因組的測序。相應的研究成果《四倍體棉花基因組測序為纖維品質(zhì)改良提供重要的資源》發(fā)表于國際頂尖雜志《自然-生物技術(shù)》。

陸地棉是世界上最重要的棉花栽培品種，占全球棉花種植面積的90%以上。中國是世界最大的產(chǎn)棉國，最大的紡織大國和最大的紡織品出口大國，在國民經(jīng)濟發(fā)展中起很重要的作用。盡管陸地棉在棉花產(chǎn)業(yè)中占據核心地位，但由于異源四倍體遺傳的復雜性，相關(guān)的全基因組測序工作一直難以開(kāi)展。本成果利用Illumina HiSeq2500最新測序平臺，結合17萬(wàn)對BAC末端序列和近5百萬(wàn)個(gè)高密度的SNP遺傳圖譜，成功構建了高質(zhì)量的陸地棉全基因組圖譜；解析了四倍體棉花兩個(gè)亞基因組的非對稱(chēng)進(jìn)化機制；發(fā)現了MYB基因家族中的一個(gè)分支在纖維發(fā)育中起重要的作用，陸地棉中多個(gè)纖維素合酶等糖代謝基因在馴化過(guò)程中受到了顯著(zhù)的正選擇作用，與棉纖維品質(zhì)改良有直接關(guān)系。陸地棉基因組測序的完成，將極大推動(dòng)棉花基因組學(xué)的研究，為棉花的遺傳改良、基礎生物學(xué)研究、多倍體作物的進(jìn)化和雜種優(yōu)勢的研究發(fā)揮重要作用。

陸地棉基因組測序計劃得到了國家973計劃、國家自然科學(xué)基金和中央高校基本科研業(yè)務(wù)費的大力支持。項目參與單位包括南京農業(yè)大學(xué)、諾禾致源生物信息科技有限公司、美國德克薩斯大學(xué)奧斯汀分校、中科院上海植物生理生態(tài)研究所、美國德州農工大學(xué)、美國農業(yè)部、澳大利亞公共健康科學(xué)與工業(yè)研究組織等國內外多家科研機構。

來(lái)源： 中國科技網(wǎng)

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